بسم الله والحمد لله والصلاة والسلام على رسول الله، وعلى آله وصحبه، ومن والاه، وبعد،
لقد صدر أول جزء من المجلة في مايو 1955، وبانتهاء عام 2000 بلغت عدة مجلداتها (44) مجلدا، كل مجلد في جزأين، وإن صدرت بعض المجلدات شاملة الجزأين معا.
وكان أول صدور للمجلة في القاهرة، وظلت تصدر فيها حتى المجلد (26) الذي صدر في عام 1980. واستأنفت الصدور في عام 1982، ولكن هذه المرة في الكويت؛ بسبب انتقال المعهد إلى تلك العاصمة العربية. وهناك بدأت بترقيم جديد؛ فقد اجتهد المسئولون عن المعهد في تلك الفترة، وأعطوا أول إصدار منها رقما جديدا تماما، فظهر في يونيو 1982 حاملا (المجلد الأول- الجزء الأول)! ثم تراجعوا، وعادوا لاستئناف الترقيم القديم، ترقيم القاهرة؛ ليكون ما يصدر في الكويت استكمالا لما صدر في القاهرة، وهكذا صدر المجلد 26، الجزء الثاني، في ديسمبر 1982. وبهذا يكون المجلد (26) بجزأيه، قد صدر مرتين؛ مرة في القاهرة، وأخرى في الكويت!
وتوالت مجلدات المجلة تصدر في الكويت في شهرين جديدين من العام، هما: يونيو وديسمبر، لا مايو ونوفمبر، كما كان الحال في القاهرة. وجاء عام 1989، فصدر في يناير منه الجزء الأول من المجلد (33)، ولم يصدر الجزء الثاني؛ إذ فقدت مادته في أثناء الأحداث التي وقعت في الخليج، في تلك الآونة!
وعاد المعهد إلى القاهرة، ليستأنف عمله منها، وعادت المجلة إلى الصدور من العاصمة المصرية مرة أخرى، وكانت البداية بصدور المجلد (34) في عام 1990، ولا تزال تصدر حتى اليوم بالقاهرة، منتظمة، متوالية. (من مقدمة الفهارس التفصلية)


وجاءت أنواع الفهارس على النحو التالي:
1 - الفهرس الموضوعي
2 - فهرس الباحثين
3 - فهرس المخطوطات المعرفة
4 - فهرس المخطوطات المحققة
5 - فهرس الكتب المعرفة والمنقودة
6 - فهرس الأعلام
7 - فهرس مواطن المخطوطات ومكتباتها
8 - فهرس المخطوطات
9 - فهرس اللوحات
10 - فهرس نشاطات المعهد وما كتب عنه
والاختصارات المستخدمة في الفهرس:
ص= صفحة
ج= جزء
مج= مجلد
كـ = ما صدر في الكويت مكررا في رقمه، إذ صدر مثله في القاهرة بالرقم نفسه، وهو تحديدا: المجلد الأول، الجزء الأول (صدر في يونيو 1982) حتى لا يلتبس بالمجلد الأول الذي صدر في القاهرة (مايو1955)، والمجلد السادس والعشرون، الجزء الثاني (صدر في ديسمبر 1982) حتى لا يلتبس بنظيره الذي صدر في القاهرة، عام 1980.
يجدر هنا التنبيه على أن مجلة معهد المخطوطات يشار لها في فهارس آل البيت، ومعجم التراث ب (م. م. خ)